سمینار با تلاوت قرآن کریم آغاز شد و سپس آقای انوری پیرامون رهنمود تنظیم امور مکافات و مجازات نهادهای تحصیلات عالی گفتند: رهنمود یادشده بر اساس مصوبه شورای رهبری وزارت تحصیلات عالی و مکتوب رسمی وزارت به دانشگاه‌های خصوصی ابلاغ گردیده و شامل چهار بخش و هشت ماده می‌باشد که شوراهای علمی دانشگاه‌ها موظف به تطبیق آن هستند.
ایشان افزودند: در این رهنمود، مفاهیم کلیدی همچون مکافات (پاداش دستاوردهای علمی و معیاری)، مجازات (اقدام تنبیهی در برابر تخلفات)، ستایش (گزارش رسمی از عملکرد برجسته) و تقدیرنامه (لوح رسمی وزارت) تعریف شده است. معیارهایی نظیر تکمیل کریدیت‌ها، برگزاری سمینارها و ورکشاپ‌ها، استخدام اعضای علمی با مدرک ماستری و برخورداری از تعمیر معیاری از جمله شاخص‌های دریافت مکافات می‌باشد. همچنین اگر تمامی پوهنځی‌های یک دانشگاه در سه سمستر متوالی ستایش شوند، وزارت تحصیلات عالی تقدیرنامه اعطا خواهد کرد.
آقای انوری بیان داشتند که در بخش تخلفات علمی، مواردی چون غیابت اعضای علمی، شامل‌کردن محصلان محروم در امتحان، تدریس خارج از نصاب تأیید شده، دادن نمرات اضافی، عدم رعایت تقویم درسی، ضعف در تحقیقات، برگزارنشدن سمینارها، نبود تجهیزات معیاری و جابه‌جایی خودسرانه مکان دانشگاه ذکر شده است. بر اساس درصد تخلفات، هیئت نظارت می‌تواند مجازات‌هایی مانند پیشنهاد اصلاحی، درج توصیه‌نامه در سوابق، صدور اخطاریه رسمی و حتی تعلیق جذب محصلان جدید را اعمال نماید.
در پایان، توضیح داده شد که رفع مجازات زمانی امکان‌پذیر است که سطح تخلفات علمی کمتر از ۱۶ درصد بوده و اقدامات اصلاحی در دانشگاه مشاهده گردد. همچنین، رهنمود اجازه می‌دهد تا نظارت مشترک با سایر ریاست‌ها اجرا شده و از آن در ارزیابی‌های درخواستی استفاده شود. تخلفات خارج از این چارچوب نیز به مقام وزارت ارجاع می‌گردد. 
این سمینار با تأکید بر ضرورت رعایت قوانین و نقش آن در ارتقای کیفیت نهادهای تحصیلات عالی خاتمه یافت.